MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015184	TTCC	2	8	124835	124842	0 %	50 %	0 %	50 %	325168411
2502	NC_015184	ACC	2	6	124874	124879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168411
2503	NC_015184	TCC	2	6	124945	124950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168411
2504	NC_015184	CAA	2	6	125033	125038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168411
2505	NC_015184	GTCC	2	8	125072	125079	0 %	25 %	25 %	50 %	325168411
2506	NC_015184	GCTC	2	8	125135	125142	0 %	25 %	25 %	50 %	325168411
2507	NC_015184	TCT	2	6	125176	125181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168411
2508	NC_015184	TCAG	2	8	125242	125249	25 %	25 %	25 %	25 %	325168411
2509	NC_015184	TC	3	6	125338	125343	0 %	50 %	0 %	50 %	325168411
2510	NC_015184	GGT	2	6	125378	125383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168411
2511	NC_015184	AAG	2	6	125392	125397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168411
2512	NC_015184	GAT	2	6	125511	125516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168411
2513	NC_015184	GCTC	2	8	125531	125538	0 %	25 %	25 %	50 %	325168411
2514	NC_015184	GCTT	2	8	125578	125585	0 %	50 %	25 %	25 %	325168411
2515	NC_015184	CAC	2	6	125604	125609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168411
2516	NC_015184	GAC	2	6	125622	125627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168411
2517	NC_015184	ACC	2	6	125669	125674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168411
2518	NC_015184	ATC	2	6	125769	125774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168411
2519	NC_015184	TGT	2	6	125877	125882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168411
2520	NC_015184	GT	4	8	125923	125930	0 %	50 %	50 %	0 %	325168411
2521	NC_015184	A	6	6	126181	126186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_015184	AGT	2	6	126289	126294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168412
2523	NC_015184	CGTT	2	8	126309	126316	0 %	50 %	25 %	25 %	325168412
2524	NC_015184	GGC	2	6	126330	126335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168412
2525	NC_015184	GGA	2	6	126355	126360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168412
2526	NC_015184	GTT	2	6	126377	126382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168412
2527	NC_015184	TCG	2	6	126462	126467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168412
2528	NC_015184	TGG	2	6	126478	126483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168412
2529	NC_015184	GCC	2	6	126539	126544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168412
2530	NC_015184	ACG	2	6	126630	126635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168412
2531	NC_015184	TCA	2	6	126639	126644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168412
2532	NC_015184	GCC	2	6	126716	126721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168412
2533	NC_015184	CG	4	8	126850	126857	0 %	0 %	50 %	50 %	325168412
2534	NC_015184	CAG	3	9	126880	126888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168412
2535	NC_015184	AAG	2	6	126915	126920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168412
2536	NC_015184	CAG	2	6	126939	126944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168412
2537	NC_015184	GCT	2	6	126980	126985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_015184	ATCA	2	8	126993	127000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_015184	GAG	2	6	127075	127080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168413
2540	NC_015184	CGC	2	6	127102	127107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168413
2541	NC_015184	GGA	2	6	127141	127146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168413
2542	NC_015184	CGG	2	6	127155	127160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168413
2543	NC_015184	GCT	2	6	127189	127194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168413
2544	NC_015184	AAC	2	6	127224	127229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168413
2545	NC_015184	GGAT	2	8	127278	127285	25 %	25 %	50 %	0 %	325168413
2546	NC_015184	ACT	2	6	127304	127309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168413
2547	NC_015184	CGG	2	6	127371	127376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168413
2548	NC_015184	TCAA	2	8	127391	127398	50 %	25 %	0 %	25 %	325168413
2549	NC_015184	CGG	2	6	127572	127577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168413
2550	NC_015184	GC	3	6	127658	127663	0 %	0 %	50 %	50 %	325168413
2551	NC_015184	GGT	2	6	127701	127706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168413
2552	NC_015184	CGG	2	6	127821	127826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168413
2553	NC_015184	GTC	2	6	127864	127869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168413
2554	NC_015184	CTG	2	6	127874	127879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168413
2555	NC_015184	TCT	2	6	127889	127894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168413
2556	NC_015184	GCT	2	6	127915	127920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168413
2557	NC_015184	CTT	2	6	127941	127946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168413
2558	NC_015184	TGC	2	6	127977	127982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168413
2559	NC_015184	AC	3	6	127984	127989	50 %	0 %	0 %	50 %	325168413
2560	NC_015184	CG	3	6	128303	128308	0 %	0 %	50 %	50 %	325168414
2561	NC_015184	CTGT	2	8	128478	128485	0 %	50 %	25 %	25 %	325168414
2562	NC_015184	ATCCG	2	10	128580	128589	20 %	20 %	20 %	40 %	325168414
2563	NC_015184	CAT	2	6	128661	128666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168414
2564	NC_015184	AGCA	2	8	128693	128700	50 %	0 %	25 %	25 %	325168414
2565	NC_015184	CAC	2	6	128705	128710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168414
2566	NC_015184	CCG	2	6	128808	128813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168415
2567	NC_015184	CTG	2	6	128827	128832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168415
2568	NC_015184	ATC	2	6	128955	128960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168415
2569	NC_015184	CGG	2	6	129026	129031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168415
2570	NC_015184	GAC	2	6	129069	129074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168415
2571	NC_015184	GTC	2	6	129208	129213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168415
2572	NC_015184	GAT	2	6	129219	129224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168415
2573	NC_015184	CATTTC	2	12	129262	129273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_015184	AGA	3	9	129338	129346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168416
2575	NC_015184	TCG	2	6	129367	129372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168416
2576	NC_015184	TGCC	2	8	129423	129430	0 %	25 %	25 %	50 %	325168416
2577	NC_015184	GC	3	6	129463	129468	0 %	0 %	50 %	50 %	325168416
2578	NC_015184	TTC	2	6	129562	129567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168416
2579	NC_015184	ACG	2	6	129661	129666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168416
2580	NC_015184	TCA	2	6	129669	129674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168416
2581	NC_015184	TCG	2	6	129802	129807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168416
2582	NC_015184	T	6	6	129827	129832	0 %	100 %	0 %	0 %	325168416
2583	NC_015184	CCA	2	6	129865	129870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168416
2584	NC_015184	GGC	3	9	129900	129908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168416
2585	NC_015184	TCA	2	6	129952	129957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168416
2586	NC_015184	CGG	2	6	130126	130131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_015184	TGG	2	6	130140	130145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015184	CCT	2	6	130160	130165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2589	NC_015184	CTC	2	6	130176	130181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_015184	GAA	2	6	130199	130204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_015184	GAAT	2	8	130215	130222	50 %	25 %	25 %	0 %	325168417
2592	NC_015184	GCC	2	6	130244	130249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168417
2593	NC_015184	GCA	2	6	130277	130282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168417
2594	NC_015184	ATA	2	6	130397	130402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168417
2595	NC_015184	CGAG	2	8	130419	130426	25 %	0 %	50 %	25 %	325168417
2596	NC_015184	AC	3	6	130453	130458	50 %	0 %	0 %	50 %	325168417
2597	NC_015184	TGA	2	6	130575	130580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168417
2598	NC_015184	GC	3	6	130612	130617	0 %	0 %	50 %	50 %	325168417
2599	NC_015184	CAA	2	6	130700	130705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168417
2600	NC_015184	CGA	2	6	130719	130724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168417
2601	NC_015184	TCG	2	6	130767	130772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168417
2602	NC_015184	GAA	2	6	130822	130827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168417
2603	NC_015184	GCA	2	6	130898	130903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168417
2604	NC_015184	AG	3	6	130982	130987	50 %	0 %	50 %	0 %	325168417
2605	NC_015184	TC	4	8	131071	131078	0 %	50 %	0 %	50 %	325168417
2606	NC_015184	AT	3	6	131093	131098	50 %	50 %	0 %	0 %	325168417
2607	NC_015184	CTAG	2	8	131099	131106	25 %	25 %	25 %	25 %	325168417
2608	NC_015184	CA	3	6	131258	131263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_015184	CAT	2	6	131270	131275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_015184	AG	3	6	131284	131289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_015184	GA	3	6	131369	131374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_015184	AAC	2	6	131383	131388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015184	CA	3	6	131393	131398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_015184	GTC	2	6	131451	131456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_015184	CT	3	6	131457	131462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_015184	GCT	2	6	131470	131475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_015184	GAC	2	6	131520	131525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_015184	GA	3	6	131651	131656	50 %	0 %	50 %	0 %	325168418
2619	NC_015184	TGGC	2	8	131657	131664	0 %	25 %	50 %	25 %	325168418
2620	NC_015184	CTCG	2	8	131737	131744	0 %	25 %	25 %	50 %	325168418
2621	NC_015184	TCT	2	6	131808	131813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168418
2622	NC_015184	CG	3	6	131845	131850	0 %	0 %	50 %	50 %	325168418
2623	NC_015184	CTTC	2	8	131903	131910	0 %	50 %	0 %	50 %	325168418
2624	NC_015184	G	6	6	131941	131946	0 %	0 %	100 %	0 %	325168418
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2731	NC_015184	TCGA	2	8	136941	136948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2742	NC_015184	TGGT	2	8	137437	137444	0 %	50 %	50 %	0 %	325168425
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2749	NC_015184	TTC	2	6	137832	137837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168425
2750	NC_015184	TCCT	2	8	137923	137930	0 %	50 %	0 %	50 %	325168425
2751	NC_015184	AGCG	2	8	137964	137971	25 %	0 %	50 %	25 %	325168425
2752	NC_015184	TGC	2	6	138016	138021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168425
2753	NC_015184	CGG	2	6	138043	138048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168425
2754	NC_015184	TGC	2	6	138083	138088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168425
2755	NC_015184	TCTGG	2	10	138183	138192	0 %	40 %	40 %	20 %	325168425
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2759	NC_015184	TCT	2	6	138332	138337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168425
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2761	NC_015184	CAT	2	6	138410	138415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2762	NC_015184	CG	3	6	138424	138429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2763	NC_015184	AAC	2	6	138484	138489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168426
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2765	NC_015184	GTCG	2	8	138612	138619	0 %	25 %	50 %	25 %	325168426
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2797	NC_015184	TCGA	2	8	140211	140218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2798	NC_015184	CTT	2	6	140282	140287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168428
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2837	NC_015184	TAG	2	6	142774	142779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2855	NC_015184	CCG	2	6	143578	143583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168432
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2860	NC_015184	TCGT	2	8	143766	143773	0 %	50 %	25 %	25 %	325168432
2861	NC_015184	ACG	2	6	143795	143800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168432
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2867	NC_015184	CG	3	6	144229	144234	0 %	0 %	50 %	50 %	325168432
2868	NC_015184	TCA	2	6	144246	144251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168432
2869	NC_015184	TGG	2	6	144294	144299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168432
2870	NC_015184	AAC	2	6	144317	144322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168432
2871	NC_015184	GAT	2	6	144331	144336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168432
2872	NC_015184	CGC	2	6	144397	144402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168433
2873	NC_015184	CGG	2	6	144411	144416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168433
2874	NC_015184	CT	3	6	144440	144445	0 %	50 %	0 %	50 %	325168433
2875	NC_015184	GC	3	6	144553	144558	0 %	0 %	50 %	50 %	325168433
2876	NC_015184	CCT	2	6	144584	144589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168433
2877	NC_015184	TTG	2	6	144683	144688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168433
2878	NC_015184	GA	3	6	144698	144703	50 %	0 %	50 %	0 %	325168433
2879	NC_015184	CTTC	2	8	144727	144734	0 %	50 %	0 %	50 %	325168433
2880	NC_015184	GTC	2	6	144853	144858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168433
2881	NC_015184	CGA	2	6	144870	144875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168433
2882	NC_015184	GC	3	6	144998	145003	0 %	0 %	50 %	50 %	325168433
2883	NC_015184	CAT	2	6	145053	145058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168433
2884	NC_015184	CGG	2	6	145104	145109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168433
2885	NC_015184	CAA	2	6	145156	145161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2886	NC_015184	TCA	2	6	145223	145228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168434
2887	NC_015184	AACCA	2	10	145257	145266	60 %	0 %	0 %	40 %	325168434
2888	NC_015184	GCG	2	6	145299	145304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2889	NC_015184	CGG	3	9	145364	145372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168435
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2891	NC_015184	GGC	2	6	145392	145397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168435
2892	NC_015184	GATCG	2	10	145452	145461	20 %	20 %	40 %	20 %	325168435
2893	NC_015184	CGT	2	6	145502	145507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168435
2894	NC_015184	GAC	2	6	145516	145521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168435
2895	NC_015184	ATCA	2	8	145535	145542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2896	NC_015184	GAA	2	6	145559	145564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2897	NC_015184	AAC	2	6	145575	145580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168436
2898	NC_015184	CG	3	6	145597	145602	0 %	0 %	50 %	50 %	325168436
2899	NC_015184	CTG	2	6	145713	145718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168436
2900	NC_015184	ATC	2	6	145719	145724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168436
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2902	NC_015184	GCC	2	6	145782	145787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168436
2903	NC_015184	ATGAAC	2	12	145857	145868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325168436
2904	NC_015184	T	6	6	145900	145905	0 %	100 %	0 %	0 %	325168436
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2906	NC_015184	GTCGC	2	10	146123	146132	0 %	20 %	40 %	40 %	325168436
2907	NC_015184	ATG	2	6	146195	146200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168437
2908	NC_015184	GAT	2	6	146204	146209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168437
2909	NC_015184	TA	3	6	146268	146273	50 %	50 %	0 %	0 %	325168437
2910	NC_015184	GAGCGA	2	12	146351	146362	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325168437
2911	NC_015184	TGA	2	6	146379	146384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168437
2912	NC_015184	TGA	2	6	146430	146435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168437
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2916	NC_015184	CGG	2	6	146528	146533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2917	NC_015184	TCT	2	6	146544	146549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2951	NC_015184	CT	3	6	148368	148373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2952	NC_015184	AACATC	2	12	148376	148387	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2963	NC_015184	CTAT	2	8	148739	148746	25 %	50 %	0 %	25 %	325168440
2964	NC_015184	CTGG	2	8	148790	148797	0 %	25 %	50 %	25 %	325168440
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2968	NC_015184	CG	3	6	148994	148999	0 %	0 %	50 %	50 %	325168440
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2979	NC_015184	CGTG	2	8	149501	149508	0 %	25 %	50 %	25 %	325168441
2980	NC_015184	CAAG	2	8	149570	149577	50 %	0 %	25 %	25 %	325168441
2981	NC_015184	CGG	2	6	149669	149674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168441
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2983	NC_015184	GAT	2	6	149765	149770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168441
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2987	NC_015184	CGC	2	6	149973	149978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168442
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2989	NC_015184	CGG	2	6	150078	150083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168442
2990	NC_015184	GATT	2	8	150097	150104	25 %	50 %	25 %	0 %	325168442
2991	NC_015184	CTA	2	6	150109	150114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168442
2992	NC_015184	CAG	2	6	150119	150124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168442
2993	NC_015184	TCG	3	9	150159	150167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168442
2994	NC_015184	GCC	2	6	150304	150309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168442
2995	NC_015184	CG	3	6	150322	150327	0 %	0 %	50 %	50 %	325168442
2996	NC_015184	TCGA	2	8	150350	150357	25 %	25 %	25 %	25 %	325168442
2997	NC_015184	TGG	2	6	150361	150366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168442
2998	NC_015184	CGG	2	6	150421	150426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168442
2999	NC_015184	TG	3	6	150497	150502	0 %	50 %	50 %	0 %	325168442
3000	NC_015184	GTC	2	6	150563	150568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168442

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